女性感染衣原體不限于尿道，可累及整個泌尿生殖器官，此類感染常因缺乏自覺癥狀或癥狀輕微而忽視了治療，造成傳染源而擴散，形成危害。
女性衣原體感染比男性感染引起的癥狀要多，其主要感染部位為宮頸，其后遺癥多導致不孕癥。
衣原體感染相關檢查
1．衣原體細胞培養：對沙眼衣原體敏感的細胞株為McCoy細胞、Hela-229細胞和BHK細胞，最常用的是經放線菌酮處理的單層McCoy細胞，孵育后，用單克隆熒光抗體染色，可迅速診斷，但操作人員一定要熟練，需專業培養。培養法的敏感性為80%-90%，陽性即可確立診斷。
2．近年來采用熒光素標記的抗衣原體單克隆抗體，來檢測細胞涂片中的衣原體，使用較為方便，目前主要用衣原體外膜蛋白（MOMP）的單克隆抗體的商品試劑。結果判斷：衣原體數>10個才能判為陽性。
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