泌尿生殖道沙眼衣原體感染被公認為性傳播疾病，是國家衛生部要求嚴格控制的性傳播疾病之一。它可以感染多個臟器，也可以在母嬰間傳播，引起的疾病非常廣泛。
對男性感染的最常見的是尿道炎，由于未治療或治療不當，會逐漸發展為附睪炎、前列腺炎，關節炎很少見。
對女性引起的感染有：
1、宮頸炎：多數沒有癥狀，有些會出現陰道分泌物異常，非經期出血、同房后出血、下腹部不舒服，婦科檢查見宮頸充血、水腫、脆性增加導致接觸后容易出血、宮頸管粘液膿性分泌物；
2、尿道炎：尿頻、尿急、尿痛，多數同時有宮頸炎，查體見尿道口充血潮紅，稍微腫脹或正常，有少量粘液膿性分泌物；
3、盆腔炎：下腹痛、腰痛、性交痛、陰道異常出血、陰道分泌物異常等，急性發作時會有高熱、寒戰、頭痛、食欲不振等全身癥狀。婦科檢查下腹部有壓痛、宮頸有舉痛，可以摸到增粗的輸卵管或者炎性腫塊。
注意：
盆腔炎是因為不治療或者治療方法不當，從陰道上行感染導致的；時間長了可能導致輸卵管炎癥粘連堵塞引起的不育、異位妊娠（宮外孕）、慢性盆腔疼痛。
男女皆可感染的有直腸炎、眼結膜炎。
生殖道沙眼衣原體是通過性接觸傳播；
孕媽媽有泌尿生殖道沙眼衣原體感染，就可能通過宮內感染、產道感染寶寶，最常見的是分娩過程中通過產道感染。
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